JRグループで2009年3月14日ダイヤ改正の内容に関して発表されたが、JR東日本本社から発表されたもの以外について、各支社の改正内容を抜粋して紹介する。
■新潟支社
○米坂線に新型車輌を増投入
米坂線内を運転する全ての列車をキハE120形とキハ110形に取替えて運転。坂町―米沢間で最大11分の運転時間短縮。これに伴ない、米坂線以外でも一部の線区で車輌を変更。
○ワンマン運転の拡大
米坂線
全列車（快速〈べにばな〉は新潟―坂町間を含む。今泉―米沢間の一部列車を除く）
羽越本線
新津10:41発新発田行
新津14:18発新発田行
新発田11:35発新津行
新発田15:53発新津行
○〈きらきらうえつ〉の喫煙スペース見直し
同列車3号車に設置していた喫煙スペースの使用を停止。車内全面禁煙に。
■八王子支社
○青梅線直通列車増発
平日の青梅8:58発東京行と東京9:36発青梅行の直通列車を増発。
○昼間帯の青梅特快増発
平日東京10:03発中央特快高尾行を青梅特快青梅行に変更。
○上り〈ホリデー快速おくたま・あきがわ〉の行先変更
土休日運転の〈ホリデー快速おくたま・あきかわ〉のうち上り列車を3本を新宿行から東京行に延長。
○八王子始発普通列車の始発駅変更
平日八王子8:09発（土・休日は8:04発）甲府行を豊田始発に変更。
○普通列車の編成増強
大月10:12発甲府行、甲府6:06発松本行をそれぞれ6輌編成にし、輸送力アップ。
○特急〈ふじかわ〉の甲府駅発車ホーム統一
身延線の特急〈ふじかわ〉を甲府駅6番線発に統一。
■大宮支社
●川越・埼京線
○南古谷6:56発→八王子8:24着の列車を増発
○指扇始発の列車1本を南古谷始発に変更。南古谷5:40発→新宿6:36着
○大宮駅での朝通勤時間帯下りの接続を改善
朝通勤時間帯の埼京線下り大宮止まりの各駅停車列車から川越行列車への乗換えを同一ホームでの乗換えに改善。
●湘南新宿ライン
○小金井発着列車の運転区間延長
南行では小金井5:43発→大船8:06の列車を宇都宮5:16発→大船8:06に変更。北行では逗子18:33発→小金井21:05着（土休日は21:10着）の列車を逗子18:33発→宇都宮21:35着（土休日は21:36着）にそれぞれ運転区間を延長。
■横浜支社
○〈ホームライナー小田原〉の使用車輌見直し
利用状況にあわせ〈ホームライナー小田原23号〉は251系10輌から185系7輌に、〈ホームライナー小田原25号〉は185系7輌から251系10輌に変更。
○鶴見線の運用見直し
利用状況により、鶴見から海芝浦・大川・扇町の各駅へ直通する列車の運転を見直し。
○各線区で乗換駅での接続時間を見直し
戸塚駅での東海道本線と横須賀線・湘南新宿ライン相互間の接続など、乗換駅での接続時間の改善を図り、乗換えを便利にする。
■千葉支社
●総武快速線
特急及び〈ホームライナー千葉〉の編成輌数見直し
◎〈しおさい9号〉 9輌→5輌
◎〈ホームライナー千葉3号〉 9輌→5輌
◎〈ホームライナー千葉7号〉 9輌→5輌
◎〈あやめ7号〉 10輌→5輌
◎〈しおさい16号〉 9輌→5輌
※〈あやめ7号〉は〈あやめ5号〉に変更となる
●外房線
◎夕通勤時間帯に京葉線東京―蘇我間運転の列車1往復を誉田まで延長運転
●総武本線・成田線
◎夕通勤時間帯の東京―成田間運転の列車1往復を成田空港まで延長運転
◎特急〈あやめ1号〉の運転区間を東京―成田間から東京―佐倉間に運転見直し。あわせて列車名を〈しおさい13号〉に変更
●内房線
◎浜野駅に快速列車が全列車停車
●京葉線
◎朝通勤時間帯の快速電車1本を各駅停車に種別変更
●そのほか
◎特急列車の指定席増加
〈さざなみ5号〉指定席：6・7号車→4～7号車
〈わかしお3号〉指定席：6・7号車→5～7号車
〈わかしお5号〉指定席：6・7号車→5～7号車
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